קוטרו של קליסטו הוא 4,821 ק"מ,יש לו 99% מהקוטר של מרקורי(כוכב חמה)אבל רק שליש מהמסה,הוא הירח הרביעי ממרחקו מצדק במרחק של 1,883,000 ק"מ מצדק והוא היחידי מבין ארבעת הירחים הגדולים של צדק שלא נמצא בתהודה מסלולית ולכן הוא לא חווה את הכוחות שמשפיעים על גנימד,איו ואירופה בכלל.
קליסטו מצולק במאות או אלפי מכתשים והוא אחד מהגופים המצולקים במערכת השמש והוא מושפע הכי פחות מהשדה המגנטי של צדק וחוטף הכי פחות קרינה לעומת שלושת הירחים האחרים,צפיפותו היא 1.83 גרם לסמ"ק והוא מורכב מכמות שווה של סלע וקרח.
סריקות שנעשו ע"י החללית גלילאו הראו שלקליסטו יש כנראה ליבה סלעית וקטנה ואולי אוקיינוס תת קרקעי בעומק של 100 ק"מ ומעלה וזה כנראה כתוצאה מתהליך היווצרותו בעבר וגם כי פעם הוא היה קרוב יותר לצדק בהתחלה,לקליסטו יש אטמ' דקיקה שמורכבת בעיקר מפחמן דו-חמצני וחמצן וגם יש לו יונוספרה די אינטסיבית.
מעבר החום ומסה(הסתה)היה איטי והתחיל קצת אחרי שהוא נוצר ולכן לא היה מספיק זמן להפרדה בין השכבות השונות בירח להיווצר וזה אולי מה שאפשר לאוקיינוס תת קרקעי להיווצר בעומק של 100-150 ק"מ ואולי גם הליבה קטנה יותר בגלל זה.

זו תמונה שצולמה ע"י החללית גלילאו בשנת 2001 ומראה את פני השטח המצולקים של הירח.

זה מכתש מאוד גדול שקוטרו 3,800 ק"מ וזה מכתש טבעתי נקרא,צולם ע"י וויאג'ר 1.

זה מודל שמציג את השכבות השונות של קליסטו אם שכבה כמו האוקיינוס שהיא עדיין בגדר השערה.

